Po zniszczeniu Glades i śmierci Tommy'ego Oliver opuszcza Starling City i wraca na wyspę. Felicity i Diggle podążają za nim, żeby przekonać go, jak bardzo potrzebny jest miastu. Okazuje się, że jego firma jest zagrożona, a nowa grupa przestępcza atakuje tych, których wini za zniszczenie dzielnicy. Oliver musi chronić siebie i swoich bliskich.
W tym odcinku Oliver Queen kontynuuje swoją przemianę. Na jego drodze staje znana z poprzedniego sezonu członkini Triady, która tym razem na cel wzięła transporty leków do szpitala w Glades.
Podczas retrospekcji Slade, Shado i Oliver odkrywają ciała japońskich żołnierzy z czasów drugiej wojny światowej.
Oliver zostaje uratowany z zasadzki przygotowanej przez Laurel. Jego wybawczyni w czarnym stroju od razu znika i Roy zaczyna jej szukać. Trafiają do Sin. Tymczasem oficer Lance odkrywa, że seryjny morderca uciekł z więzienia podczas trzęsienia ziemi i ponownie zabija. Sytuacja robi się niebezpieczna, kiedy w jego rękach znajduje się Laurel i jej ojciec.
Oliver odkrywa, że tajemniczą bohaterką jest Sara - siostra Laurel, o której śmierci był przekonany od dawna. Laurel ma coraz większe problemy z alkoholem. W mieście zaczyna działać grupa pod dowództwem "Burmistrza". Przechwytują ładunek broni i planują zaatakować imprezę organizowaną przez Olivera i Blooda. Arrow korzysta z pomocy swojej nowej sojuszniczki.
W willi Oliver i Sara zostają zaatakowani przez mężczyznę ubranego, jak kiedyś Malcolm Merlyn. Nowa sojuszniczka Arrowa wyznaje, że to ona była celem Ligi Zabójców. Chcą ją ukarać za opuszczenie organizacji. Po kolejnym starciu wrogowie zapowiadają, że zabiją rodzinę Lance. Sara decyduje pokazać się ojcu, żeby zapewnić mu bezpieczeństwo. Moira szykuje się do obrony w swoim procesie.
W retrospekcjach dowiadujemy się, jak Sara przeżyła rozbicie "Gambita Hetmańskiego" (ang. "Queen's Gambit") oraz o roli Anthonego Ivo w jej życiu.
Oliver i Diggle ruszają do Rosji, żeby odnaleźć agentkę Lylę Michaels, która - jak się okazuje - podążała za Deadshot'em. Isabela sądząc, że Queen chce robić interesy za jej plecami dołącza się do bohaterów. Lyla jest trzymana w gułagu, gdzie zgodnie z planem zostaje zamknięty John.
W retrospekcjach Ivo wyznaje, że znalezieni więźniowie wieźli potężne serum, dające siłę i zdolność regeneracji.
Podczas trzęsienia ziemi w Glades z więzienia uciekł "Hrabia" (ang. "the Count"). Ponownie zaczyna rozprowadzać Vertigo i wśród zatrutych znajduje się Diggle. Podczas procesu Moiry Queen, Laurel wyjawia informacje o romansie oskarżonej z Malcolmem. Fakt ten pogarsza i tak już złą sytuację matki Olivera.
W retrospekcjach Slade i Shado starają się odbić Olivera i Sarę z rąk dr. Ivo.
Z laboratorium Queen Consolidated zamaskowany mężczyzna o nadzwyczajnej sile kradnie wirówkę. Z Cental City przyjeżdża naukowiec Barry Allen, aby pomóc w śledztwie. Okazuje się, że poszukuje on nadzwyczajnych wydarzeń, mając nadzieję na odnalezienie morderców jego matki. Arrow uzmysławia sobie, że złodziej użył tej samej substancji, której lata wcześniej poszukiwał Ivo.
Barry'emu udaje się uratować życie Olivera, ale jest zły, że ten poznał jego tożsamość. Ekipie udaje się też odkryć tożsamość potężnego napastnika - jest to Cyrus Gold. Swoje własne śledztwo prowadzi też Roy, który w końcu zostaje porwany i Sebastian podaje mu serum. Wtedy bazę atakuje Oliver.
W retrospekcjach dowiadujemy się, że Ivo daje wybór Oliverowi, którą z kobiet ma zabić.
Oliver kontynuuje swoje poszukiwania mężczyzny w masce, a Felicity wyjeżdża do Central City do Barry'ego pogrążonego w śpiączce. Tymczasem w mieście zaczyna działać Mark Scheffer, znany też jako "Shrapnel". Specjalizuje się w podkładaniu bomb i za swój kolejny cel bierze imprezę organizowaną przez Sebastiana. Laurel natomiast zaczyna dalej wgłębiać się w przeszłość nowego kandydata na burmistrza.
Blood odwiedza swoją matkę i dowiaduje się, że Laurel zna prawdę o śmierci jego ojca. Postanawia oczyścić się z zarzutów oraz zdyskredytować młodą prawniczkę. W tym czasie Oliver ciągle poszukuje mężczyzny w masce i Laurel podsuwa mu pomysł, że może to być Sebastian. Arrow rozpoczyna też trening Roy'a, ale ten nie umie panować nad swoimi emocjami.
W retrospekcjach Ivo proponuje Sarze opuszczenie wyspy w zamian za Mirakuru.
Roy rozpoczyna swój trening pod okiem Arrow, ucząc się kontrolować swój gniew. W między czasie na pierwszy plan wraca Moira Queen podejmując zupełnie nowe przedsięwzięcie. Pojawia się też znany z początku sezonu Bronze Tiger, którego nowym zadaniem jest przejęcie znanej widzom, śmiercionośnej broni.
Do Starling City przybywa Nyssa al'Ghul, aby odzyskać Sarę. W tym czasie Felicity odkrywa tajemnicę Moiry Queen, której kampania wyborcza nabiera tempa. W tym odcinku mamy też duże zawirowania wokół całej rodziny Lance.
W mieście rozpoczyna atak nowy złoczyńca. Hakuje systemy zabezpieczeń banków, aby w dokładnie wyznaczonym czasie ukraść z nich pieniądze. Felicity czuje się odtrącona po pojawieniu się Sary. Detektyw Lance stara się połączyć na nowo rodzinę, ale Laurel jak zawsze to utrudnia.
Po spotkaniu Slade'a Wilsona w swoim domu Olivier musi zachowywać pozory, aby nie zdradzić się przed matką i siostrą. Daje znać swoim przyjaciołom. W retrospekcjach natomiast Olivier, Sarah i Slade szykują się do przejęcia transportowca doktora Ivo. Sarah ostrzega Queena, że jeśli Wilson pozna prawdę o śmierci Shado oboje zginą.
Olivier próbuje zlokalizować Slade'a Wilsona korzystając z usług rosyjskiej mafii, do której rzekomo należy. Stara się też odciąć od siebie bliskie osoby, żeby wróg nie miał powodu ich krzywdzić. W tym czasie Johny Diggle zostaje poproszony przez A.R.G.U.S. o pomoc w przejęciu niebezpiecznej substancji. Pracuje razem z Suicide Squad.
W mieście pojawia się Frank Bertinelli, ojciec Heleny, znanej też jako Huntress. Oliver spodziewa się, że ona niedługo się pojawi, aby go zabić. Laurel ma niezwykłą okazję powrócić do zawodu prawnika - dostaje możliwość działania w sprawie Franka. Kiedy Helena bierze zakładników, a wśród nich znajduje się Laurel, bohaterowie muszą interweniować. W tym czasie Roy zaczyna rozumieć jakie zagrożenie sprawia będąc dalej z Thea Queen.
Thea została porwana przez Slade'a. Oliver martwi się jej nieobecnością, a o wszystkim dowiaduje się podczas debaty, w której uczestniczy jego matka oraz Sebastian Blood. Team Arrow dość szybko dociera do Wilsona, ale nie wszystko układa się zgodnie z planem. W między czasie Isabel naciska na Olivera, żeby na poważnie zajął się firmą.
Team Arrow zaczyna aktywnie walczyć z Slade'm. Najpierw niszczą potrzebne mu zasoby, ale Wilson gwałtownie odpowiada pojawiając się w ich bazie. Thea jest ciągle załamana straszną prawdą o swoim pochodzeniu, a Oliver potrzebuje jej do załatwienia spraw majątkowych rodziny. Laurel po tym, jak zamknięto jej ojca w więzieniu zastanawia się, jak wykorzystać cenną wiadomość otrzymaną od Slade'a.
Roy nagle budzi się ze śpiączki, przeraża Felicity i ucieka. Wywołuje pewne zamieszanie w mieście wdając się w niepotrzebne bójki. Oliver i Sarah starają się go odnaleźć. Moira natomiast musi podjąć decyzję w sprawie swojej kampanii. Poznajemy też część historii Olivera sprzed wypadku na jachcie.
Oliver i Sarah zniknęli. W tym czasie odbywa się pogrzeb Moiry Queen. Laurel ponownie zaczyna podejrzewać Sebastiana, świeżo zaprzysiężonego burmistrza Starling City o nieczyste zagrania i ponownie zachęca Quentina do interwencji. Na stypie pojawia się też Isabel i z przyjemnością grozi Diggle'owi oraz Felicity.
Armia Slade'a rozbiega się po mieście. Po intensywnej walce na posterunku udaje się zatrzymać napastnika i zorganizować działanie jednostki. Na dworcu zamaskowany bierze na cel Thea'e, a Oliver stara się uratować Laurel zasypaną gruzami. Diggle natomiast musi pokonać Isabel, która chce się zemścić za to, że prawie ją zabił.
Sytuacja na wyspie też staje się coraz gorętsza i zmierza do wielkiego finału. Oliver postanawia wyruszyć, aby ocalić Sarę. Podejrzewa, że Slade więzi ją na frachtowcu.
Wojna o Starling City trwa w najlepsze. Serum dostarczone przez Blood'a okazuje się działać. Jednak bohaterowie nie są bezpieczni, ponieważ do ich bazy zmierza grupa uzbrojonych żołnierzy Slade'a. Dość szybko Arrow kompletuje drużynę, z którą jest w stanie bronić miasto. Diggle i Lyla jadą do siedziby A.R.G.U.S., żeby zapobiec atakowi bombowemu na miasto, a Sarah sprowadza przedstawicieli Ligi Zabójców. To jednak ciągle wydaje się mało w stosunku do potencjału wroga. Na dodatek Oliver ciągle nie wie, jak chce zakończyć tę wojnę.